Dans metroid prime, les combos font leur apparition. Bien que certains effets de ces combos soient deja connue, leur apprentissage est bien different. En effet, pour pouvoir utiliser une combo, il faut tout d'abors l'activer en trouvant un objet de combo. Il faut ensuite respecter les indications presentes ci dessous.

Super Missiles
Etant donné que vous êtes obligés de l´obtenir, je ne vous fait pas trop de dessins... Il se trouve dans la base de recherche pirate à Phendrana : Observatory

Ice Spreader
Magmoor Caverns - Shore Tunnel ( à côté de Monitor Station)
Les fans de Metroid III voudront immédiatement poser une power bomb dans ce tunnel de verre, se remémorant à juste titre l´épisode entre Brinstar et Maridia... Grand bien leur prendra car juste en dessous ce trouve un combo particulièrement utile...

Wave Buster
Chozos Ruins - Tower of light
Vous n´avez qu´à monter au plus haut de cette tour ensoleillé pour le trouver... Pour cela, n´hésiter pas à tirer au missile sur les colonnes fissurées afin de faire s´écrouler la tour!!! 3 missiles par colonne, x 4 par étage, x 4 étages... Vous voyez qu´il vous faudra pas mal de missiles avant d´avoir le Wave Buster. Au passage vous pourrez avoir à vous battre contre le monstre le plus dangereux de Metroid Prime, le Plated Puffer! Sans rire, si vous entrez dans son nuage de gaz, il peut vous ôter 200 à 400 pts de vie sans aucun problème!!! Mais c´est juste pour l´anecdote ^^

Flamethrower
Phazon Mines - Mining Security Tunnel ( la seule pièce du premier niveau des mines à avoir une porte rouge)
Posez une power bomb contre le grillage, et pénétrer dans cette pièce... Un combo INUTILE...